Carica papaya scaffold sequences Enter ID & coordinates above and click "Go", or select a BAC ID below.
Select scaffold id
187574662 187574661 187574660 187574659 187574658 187574657 187574656 187574655 187574654 187574653 187574652 187574651 187574650 187574649 187574648 187574647 187574646 187574645 187574644 187574643 187574642 187574641 187574640 187574639 187574638 187574637 187574636 187574635 187574634 187574633 187574632 187574631 187574630 187574629 187574628 187573627 187572626 187572625 187572624 187572623 187572622 187572621 187572620 187572619 187572618 187572617 187572616 187572615 187572614 187572613 187572612 187572611 187572610 187572609 187572608 187572607 187572606 187572605 187572604 187572603 187572602 187572601 187572600 187572599 187572598 187572597 187572596 187572595 187572594 187572593 187572592 187572591 187572590 187572589 187572588 187572587 187572586 187572585 187572584 187572583 187572582 187572581 187572580 187572579 187572578 187572577 187572576 187572575 187572574 187572573 187572572 187572571 187572570 187572569 187572568 187572567 187572566 187572565 187572564 187572563 187572562 187572561 187572560 187572559 187572558 187572557 187572556 187572555 187572554 187572553 187572552 187572551 187572550 187572549 187572548 187572547 187572546 187572545 187572544 187572543 187572542 187572541 187572540 187572539 187572538 187572537 187572536 187572535 187572534 187572533 187572532 187572531 187572530 187572529 187572528 187572527 187572526 187572525 187572524 187572523 187572522 187572521 187572520 187572519 187572518 187572517 187572516 187572515 187572514 187572513 187572512 187572511 187571510 187571509 187571508 187571507 187570506 187570505 187570504 187570503 187570502 187570501 187570500 187570499 187570498 187570497 187570496 187570495 187570494 187570493 187570492 187570491 187570490 187570489 187570488 187570487 187570486 187570485 187570484 187570483 187570482 187570481 187570480 187570479 187570478 187570477 187570476 187570475 187570474 187570473 187570472 187570471 187570470 187570469 187570468 187570467 187570466 187570465 187570464 187570463 187570462 187570461 187570460 187570459 187570458 187570457 187570456 187570455 187570454 187570453 187570452 187570451 187570450 187570449 187570448 187570447 187570446 187570445 187570444 187570443 187570442 187570441 187570440 187570439 187570438 187570437 187570436 187570435 187570434 187570433 187570432 187570431 187570430 187570429 187570428 187570427 187570426 187570425 187570424 187570423 187570422 187570421 187570420 187570419 187570418 187570417 187570416 187570415 187570414 187570413 187570412 187570411 187570410 187570409 187570408 187570407 187570406 187570405 187570404 187570403 187570402 187570401 187570400 187570399 187570398 187570397 187570396 187570395 187570394 187570393 187570392 187570391 187570390 187570389 187570388 187570387 187570386 187570385 187570384 187570383 187570382 187570381 187570380 187570379 187570378 187570377 187570376 187570375 187570374 187570373 187570372 187570371 187570370 187570369 187570368 187570367 187570366 187570365 187570364 187570363 187570362 187570361 187570360 187570359 187570358 187570357 187570356 187570355 187570354 187570353 187570352 187570351 187570350 187570349 187570348 187570347 187570346 187570345 187570344 187570343 187570342 187570341 187570340 187570339 187570338 187570337 187570336 187570335 187570334 187570333 187570332 187570331 187570330 187570329 187570328 187570327 187570326 187570325 187570324 187570323 187570322 187570321 187570320 187570319 187570318 187570317 187570316 187570315 187570314 187570313 187570312 187570311 187570310 187570309 187570308 187570307 187570306 187570305 187570304 187570303 187570302 187570301 187570300 187570299 187570298 187570297 187570296 187570295 187570294 187570293 187570292 187570291 187570290 187570289 187570288 187570287 187570286 187570285 187570284 187570283 187570282 187570281 187570280 187570279 187570278 187570277 187570276 187570275 187570274 187570273 187570272 187570271 187570270 187570269 187570268 187570267 187570266 187570265 187570264 187570263 187570262 187570261 187570260 187570259 187570258 187570257 187570256 187570255 187570254 187570253 187570252 187570251 187570250 187570249 187570248 187570247 187570246 187570245 187570244 187570243 187570242 187570241 187570240 187570239 187570238 187570237 187570236 187570235 187570234 187570233 187570232 187570231 187570230 187570229 187570228 187570227 187570226 187570225 187570224 187570223 187570222 187570221 187570220 187570219 187570218 187570217 187570216 187570215 187570214 187570213 187570212 187570211 187570210 187570209 187570208 187570207 187570206 187570205 187570204 187570203 187570202 187570201 187570200 187570199 187570198 187570197 187570196 187570195 187570194 187570193 187570192 187570191 187570190 187570189 187570188 187570187 187570186 187570185 187570184 187570183 187570182 187570181 187570180 187570179 187570178 187570177 187570176 187570175 187570174 187570173 187570172 187570171 187570170 187570169 187570168 187570167 187570166 187570165 187570164 187570163 187570162 187570161 187570160 187570159 187570158 187570157 187570156 187570155 187570154 187570153 187570152 187570151 187570150 187570149 187570148 187570147 187570146 187570145 187570144 187570143 187570142 187570141 187570140 187570139 187570138 187570137 187570136 187570135 187570134 187570133 187570132 187570131 187570130 187570129 187570128 187570127 187570126 187570125 187570124 187570123 187570122 187570121 187570120 187570119 187570118 187570117 187570116 187570115 187570114 187570113 187570112 187570111 187570110 187570109 187570108 187570107 187570106 187570105 187570104 187570103 187570102 187570101 187570100 187570099 187570098 187570097 187570096 187570095 187570094 187570093 187570092 187570091 187570090 187570089 187570088 187570087 187570086 187570085 187570084 187570083 187570082 187570081 187570080 187570079 187570078 187570077 187570076 187570075 187570074 187570073 187570072 187570071 187570070 187570069 187570068 187570067 187570066 187570065 187570064 187570063 187570062 187570061 187570060 187570059 187570058 187570057 187570056 187570055 187570054 187570053 187570052 187570051 187570050 187570049 187570048 187570047 187570046 187570045 187570044 187570043 187570042 187570041 187570040 187570039 187570038 187570037 187570036 187570035 187570034 187570033 187570032 187570031 187570030 187570029 187570028 187570027 187570026 187570025 187570024 187570023 187570022 187570021 187570020 187570019 187570018 187570017 187570016 187570015 187570014 187570013 187570012 187570011 187570010 187570009 187570008 187570007 187570006 187570005 187570004 187570003 187570002 187570001 187570000 187569999 187569998 187569997 187569996 187569995 187569994 187569993 187569992 187569991 187569990 187569989 187569988 187569987 187569986 187569985 187569984 187569983 187569982 187569981 187569980 187569979 187569978 187569977 187569976 187569975 187569974 187569973 187569972 187569971 187569970 187569969 187569968 187569967 187569966 187569965 187569964 187569963 187569962 187569961 187569960 187569959 187569958 187569957 187569956 187569955 187569954 187569953 187569952 187569951 187569950 187569949 187569948 187569947 187569946 187569945 187569944 187569943 187569942 187569941 187569940 187569939 187569938 187569937 187569936 187569935 187569934 187569933 187569932 187569931 187569930 187569929 187569928 187569927 187569926 187569925 187569924 187569923 187569922 187569921 187569920 187569919 187569918 187569917 187569916 187569915 187569914 187569913 187569912 187569911 187569910 187569909 187569908 187569907 187569906 187569883 187569882 187569881 187569880 187569879 187569878 187569877 187569876 187569875 187569874 187569873 187569872 187569869 187569868 187569867 187569866 187569865 187569864 187569863 187569862 187569861 187569860 187569857 187569856 187569855 187569854 187569853 187569852 187569851 187569850 187569849 187569846 187569845 187569844 187569843 187569842 187569841 187569840 187569839 187569838 187569837 187569836 187569835 187569834 187569831 187569830 187569829 187569828 187569827 187569826 187569825 187569824 187569821 187569820 187569819 187569818 187569817 187569816 187569815 187569814 187569813 187569810 187569809 187569808 187569807 187569806 187569805 187569804 187569803 187569802 187569801 187569800 187569797 187569796 187569795 187569794 187569793 187569792 187569791 187569790 187569789 187569786 187569785 187569784 187569783 187569782 187569781 187569780 187569779 187569776 187569775 187569774 187569773 187569772 187569771 187569770 187569769 187569768 187569767 187569764 187569763 187569762 187569761 187569760 187569759 187569758 187569757 187569756 187569753 187569752 187569751 187569750 187569749 187569748 187569747 187569746 187569745 187569742 187569741 187569740 187569739 187569738 187569737 187569736 187569735 187569734 187569733 187569732 187569731 187569730 187569727 187568726 187568722 187568721 187568720 187568719 187568718 187568717 187568716 187568715 187568714 187568713 187568712 187568708 187567707 187567706 187567702 187567701 187567700 187567699 187567698 187567697 187567696 187567695 187567694 187567693 187567689 187567688 187567687 187567686 187567685 187567684 187567680 187567679 187567678 187567677 187567676 187567675 187567674 187567673 187567669 187567668 187567667 187567666 187567665 187567664 187567663 187567662 187567661 187567660 187567656 187567655 187567654 187567653 187567652 187567651 187567650 187567649 187567648 187567647 187567646 187567642 187567641 187567640 187567639 187567638 187567637 187567636 187567635 187567634 187567633 187567632 187567631 187567630 187567629 187567628 187567627 187567626 187567625 187567624 187567623 187567622 187567621 187567620 187567619 187567615 187567614 187567613 187567612 187567611 187567610 187567609 187567608 187567607 187567603 187567602 187567601 187567600 187567599 187567598 187567597 187567596 187567595 187567594 187567590 187567589 187567588 187567587 187567586 187567585 187567584 187567583 187567579 187567578 187567577 187567576 187567575 187567574 187567573 187567569 187567568 187567567 187567566 187567565 187567564 187567563 187567562 187567561 187567560 187567559 187567558 187567557 187567553 187567552 187567551 187567550 187567549 187567548 187567547 187567543 187567542 187567541 187567540 187567539 187567538 187567537 187567536 187567535 187567534 187567530 187567529 187567528 187567527 187567526 187567525 187567521 187567520 187567519 187567518 187567517 187567516 187567515 187567514 187567513 187567512 187567511 187567507 187567506 187567505 187567504 187567503 187567502 187567501 187567500 187567499 187567498 187567494 187567493 187567492 187567491 187567490 187567489 187567488 187567487 187567486 187567485 187567484 187567483 187567482 187567478 187567477 187567476 187567475 187567474 187567473 187567472 187567471 187567470 187567469 187567468 187567464 187567463 187567462 187567461 187567460 187567459 187567458 187567457 187567456 187567455 187567451 187567450 187567449 187567448 187567447 187567446 187567442 187567441 187567440 187567439 187567438 187567437 187567436 187567435 187567434 187567433 187567429 187567428 187567427 187567426 187567425 187567424 187567423 187567422 187567421 187567420 187567416 187567415 187567414 187567413 187567412 187567411 187567410 187567409 187567408 187567407 187567406 187567402 187567401 187567400 187567399 187567398 187567397 187567396 187567395 187567394 187567393 187567392 187567388 187567387 187567386 187567385 187567384 187567383 187567382 187567381 187567380 187567379 187567375 187567374 187567373 187567372 187567371 187567370 187567369 187567368 187567367 187567366 187567365 187567361 187567360 187567359 187567358 187567357 187567356 187567355 187567354 187567353 187567349 187567348 187567347 187567346 187567345 187567344 187567343 187567342 187567341 187567340 187567336 187567335 187567334 187567333 187567332 187567331 187567330 187567329 187567328 187567327 187567326 187567325 187567324 187567320 187567319 187567318 187567317 187567316 187567315 187567314 187567313 187567309 187567308 187567307 187567306 187567305 187567304 187567303 187567302 187567301 187567300 187567299 187567295 187567294 187567293 187567292 187567291 187567290 187567289 187567288 187567287 187567283 187567282 187567281 187567280 187567279 187567278 187567277 187567276 187567272 187567271 187567270 187567269 187567268 187567267 187567266 187567265 187567264 187567263 187567259 187567258 187567257 187567256 187567255 187567254 187567253 187567252 187567251 187567250 187567249 187567248 187567247 187567243 187567242 187567241 187567240 187567239 187567238 187567237 187567236 187567235 187567234 187567233 187567232 187567231 187567227 187567226 187567225 187567224 187567223 187567222 187567221 187567220 187567219 187567218 187567217 187567213 187567212 187567211 187567210 187567209 187567208 187567207 187567206 187567205 187567204 187567203 187567199 187567198 187567197 187567196 187567195 187567194 187567193 187567192 187567191 187567190 187567189 187567185 187567184 187567183 187567182 187567181 187567180 187567179 187567178 187567177 187567176 187567175 187567171 187567170 187567169 187567168 187567167 187567166 187567165 187567164 187567163 187567162 187567158 187567157 187567156 187567155 187567154 187567153 187567152 187567151 187567150 187567149 187567148 187567147 187567146 187567145 187567144 187567143 187567139 187567138 187567137 187567136 187567135 187567134 187567130 187567129 187567128 187567127 187567126 187567125 187567124 187567123 187567122 187567121 187567120 187567119 187567115 187567114 187567113 187567112 187567111 187567110 187567109 187567108 187567107 187567103 187567102 187567101 187567100 187567099 187567098 187567097 187567096 187567095 187567091 187567090 187567089 187567088 187567087 187567086 187567085 187567084 187567083 187567082 187567081 187567080 187567079 187567075 187567074 187567073 187567072 187567071 187567070 187567069 187567068 187567067 187567066 187567062 187567061 187567060 187567059 187567058 187567057 187567056 187567055 187567051 187567050 187567049 187567048 187567047 187567046 187567045 187567044 187567043 187567042 187567041 187567040 187567036 187567035 187567034 187567033 187567032 187567031 187567030 187567026 187567025 187567024 187567023 187567022 187567021 187567020 187567019 187567018 187567017 187567016 187567015 187567011 187567010 187567009 187567008 187567007 187567006 187567005 187567004 187567003 187567002 187567001 187567000 187566999 187566995 187566994 187566993 187566992 187566991 187566990 187566989 187566988 187566987 187566986 187566985 187566981 187566980 187566979 187566978 187566977 187566976 187566975 187566974 187566973 187566972 187566971 187566970 187566969 187566965 187566964 187566963 187566962 187566961 187566960 187566956 187566955 187566954 187566953 187566952 187566951 187566950 187566949 187566948 187566944 187566943 187566942 187566941 187566940 187566939 187566938 187566937 187566936 187566935 187566934 187566933 187566932 187566931 187566927 187566926 187566925 187566924 187566923 187566922 187566921 187566920 187566919 187566918 187566917 187566916 187566915 187566911 187566910 187566909 187566908 187566907 187566906 187566905 187566904 187566903 187566902 187566901 187566900 187566899 187566898 187566897 187566896 187566895 187566894 187566893 187566892 187566891 187566890 187566889 187566888 187566887 187566886 187566885 187566884 187566883 187566882 187566881 187566880 187566879 187566878 187566877 187566876 187566875 187566874 187566873 187566872 187566871 187566870 187566869 187566868 187566867 187566866 187566865 187566864 187566863 187566862 187566861 187566860 187566859 187566858 187566857 187566856 187566855 187566854 187566853 187566852 187566851 187566850 187566849 187566848 187566847 187566846 187566845 187566844 187566843 187566842 187566841 187566840 187566839 187566838 187566837 187566836 187566835 187566834 187566833 187566832 187566831 187566830 187566829 187566828 187566827 187566826 187566825 187566824 187566823 187566822 187566821 187566820 187566819 187566818 187566817 187566816 187566815 187566814 187566813 187566812 187566811 187566810 187566809 187566808 187566807 187566806 187566805 187566804 187566803 187566802 187566801 187566800 187566799 187566798 187566797 187566796 187566795 187566794 187566793 187566792 187566791 187566790 187566789 187566788 187566787 187566786 187566785 187566784 187566783 187566782 187566781 187566780 187566779 187566778 187566777 187566776 187566775 187566774 187566773 187566772 187566771 187566770 187566769 187566768 187566767 187566766 187566765 187566764 187566763 187566762 187566761 187566760 187566759 187566758 187566757 187566756 187566755 187566754 187566753 187566752 187566751 187566750 187566749 187566748 187566747 187566746 187566745 187566744 187566743 187566742 187566741 187566740 187566739 187566738 187566737 187566736 187566735 187566734 187566733 187566732 187566731 187566730 187566729 187566728 187566727 187566726 187566725 187566724 187566723 187566722 187566721 187566720 187566719 187566718 187566717 187566716 187566715 187566714 187566713 187566712 187566711 187566710 187566709 187566708 187566707 187566706 187566705 187566704 187566703 187566702 187566701 187566700 187566699 187566698 187566697 187566696 187566695 187566694 187566693 187566692 187566691 187566690 187566689 187566688 187566687 187566686 187566685 187566684 187566683 187566682 187566681 187566680 187566679 187566678 187566677 187566676 187566675 187566674 187566673 187566672 187566671 187566670 187566669 187566668 187566667 187566666 187566665 187566664 187566663 187566662 187566661 187566660 187566659 187566658 187566657 187566656 187566655 187566654 187566653 187566652 187566651 187566650 187566649 187566648 187566647 187566646 187566645 187566644 187566643 187566642 187566641 187566640 187566639 187566638 187566637 187566636 187566635 187566634 187566633 187566632 187566631 187566630 187566629 187566628 187566627 187566626 187566625 187566624 187566623 187566622 187566621 187566620 187566619 187566618 187566617 187566616 187566615 187566614 187566613 187566612 187566611 187566610 187566609 187566608 187566607 187566606 187566605 187566604 187566603 187566602 187566601 187566600 187566599 187566598 187566597 187566596 187566595 187566594 187566593 187566592 187566591 187566590 187566589 187566588 187566587 187566586 187566585 187566584 187566583 187566582 187566581 187566580 187566579 187566578 187566577 187566576 187566575 187566574 187566573 187566572 187566571 187566570 187566569 187566568 187566567 187566566 187566565 187566564 187566563 187566562 187566561 187566560 187566559 187566558 187566557 187566556 187566555 187566554 187566553 187566552 187566551 187566550 187566549 187566548 187566547 187566546 187566545 187566544 187566543 187566542 187566541 187566540 187566537 187566536 187566535 187566534 187566533 187566532 187566531 187566530 187566529 187566528 187566527 187566526 187566525 187566522 187566521 187566520 187566519 187566518 187566517 187566516 187566515 187566514 187566513 187566512 187566511 187566510 187566507 187566506 187566505 187566504 187566503 187566502 187566501 187566500 187566499 187566498 187566497 187566496 187566495 187566494 187566493 187566490 187566489 187566488 187566487 187566486 187566485 187566484 187566483 187566482 187566481 187566480 187566477 187566476 187566475 187566474 187566473 187566472 187566471 187566470 187566469 187566468 187566465 187566464 187566463 187566462 187566461 187566460 187566459 187566458 187566457 187566456 187566455 187566454 187566453 187566452 187566449 187566448 187566447 187566446 187566445 187566444 187566443 187566442 187566441 187566440 187566439 187566438 187566437 187566435 187566434 187566433 187566432 187566431 187566430 187566429 187566428 187566427 187566426 187566425 187566424 187566422 187566421 187566420 187566419 187566418 187566417 187566416 187566415 187566414 187566413 187566412 187566411 187566409 187566408 187566407 187566406 187566405 187566404 187566403 187566402 187566401 187566400 187566399 187566398 187566396 187566395 187566394 187566393 187566392 187566391 187566390 187566389 187566388 187566387 187566386 187566384 187566383 187566382 187566381 187566380 187566379 187566378 187566377 187566376 187566375 187566374 187566373 187566372 187566371 187566370 187566369 187566367 187566366 187566365 187566364 187566363 187566362 187566361 187566360 187566359 187566358 187566357 187566356 187566355 187566354 187566353 187566351 187566350 187566349 187566348 187566347 187566346 187566345 187566344 187566343 187566342 187566340 187566339 187566338 187566337 187566336 187566335 187566334 187566333 187566332 187566331 187566330 187566328 187565327 187565326 187565325 187565324 187565323 187565322 187565321 187565320 187565319 187565316 187565313 187564312 187564311 187564310 187564307 187564306 187564303 187564302 187564301 187564300 187564299 187564298 187564297 187564296 187564295 187564294 187564293 187564292 187564289 187564288 187564287 187564286 187564285 187564284 187564283 187564282 187564281 187564280 187564279 187564278 187564275 187564274 187564273 187564272 187564271 187564270 187564269 187564268 187564267 187564266 187564265 187564262 187564261 187564260 187564259 187564258 187564257 187564256 187564255 187564254 187564253 187564252 187564249 187564248 187564247 187564246 187564245 187564244 187564243 187564160 187564159 187564158 187564157 187564156 187564155 187564154 187564153 187564152 187564151 187564150 187564149 187564148 187564147 187564146 187564145 187564144 187564143 187564142 187564141 187564140 187564139 187564138 187564137 187564136 187564135 187564134 187564133 187564132 187564131 187564130 187564129 187564128 187564127 187564126 187564125 187564124 187564123 187564122 187564121 187564120 187564119 187564118 187564117 187564116 187564115 187564114 187564113 187564112 187564111 187564110 187564109 187564108 187564107 187564106 187564105 187564104 187564103 187564102 187564101 187564100 187564099 187564098 187564097 187564096 187564095 187564094 187564093 187564092 187564091 187564090 187564089 187564088 187564087 187564086 187564085 187564084 187564083 187564082 187564081 187564080 187564079 187564078 187564077 187564076 187564075 187564074 187564073 187564072 187564071 187564070 187564069 187564068 187564067 187564066 187564065 187564064 187564063 187564062 187564061 187564060 187564059 187564058 187564057 187564056 187564055 187564054 187564053 187564052 187564051 187564050 187564049 187564048 187564047 187564046 187564045 187564044 187564043 187564042 187564041 187564040 187564039 187564038 187564037 187564036 187564035 187564034 187564033 187564032 187564031 187564030 187564029 187564028 187564027 187564026 187564025 187564024 187564023 187564022 187564021 187564020 187564019 187564018 187564017 187564016 187564015 187564014 187564013 187564012 187564011 187564010 187564009 187564008 187564007 187564006 187564005 187564004 187564003 187564002 187564001 187564000 187563999 187563998 187563997 187563996 187563995 187563994 187563993 187563992 187563991 187563990 187563989 187563988 187563987 187563986 187563985 187563984 187563983 187563982 187563981 187563980 187563979 187563978 187563977 187563976 187563975 187563974 187563973 187563972 187563971 187563970 187563969 187563968 187563967 187563966 187563965 187563964 187563963 187563962 187563961 187563960 187563959 187563958 187563957 187563956 187563955 187563954 187563953 187563952 187563951 187563950 187563949 187563948 187563947 187563946 187563945 187563944 187563943 187563942 187563941 187563940 187563939 187563938 187563937 187563936 187563935 187563934 187563933 187563932 187563931 187563930 187563929 187563928 187563927 187563926 187563925 187563924 187563923 187563922 187563921 187563920 187563919 187563918 187563917 187563916 187563915 187563914 187563913 187563912 187563911 187563910 187563909 187563908 187563907 187563906 187563905 187563904 187563903 187563902 187563901 187563900 187563899 187563898 187563897 187563896 187563895 187563894 187563893 187563892 187563891 187563890 187563889 187563888 187563887 187563886 187563885 187563884 187563883 187563882 187563881 187563880 187563879 187563878 187563877 187563876 187563875 187563874 187563873 187563872 187563871 187563870 187563869 187563868 187563867 187563866 187563865 187563864 187563863 187563862 187563861 187563860 187563859 187563858 187563857 187563856 187563855 187563854 187563853 187563852 187563851 187563850 187563849 187563848 187563847 187563846 187563845 187563844 187563843 187563842 187563841 187563840 187563839 187563838 187563837 187563836 187563835 187563834 187563833 187563832 187563831 187563830 187563829 187563828 187563827 187563826 187563825 187563824 187563823 187563822 187563821 187563820 187563819 187563818 187563817 187563816 187563815 187563814 187563813 187563812 187563811 187563810 187563809 187563808 187563807 187563806 187563805 187563804 187563803 187563802 187563801 187563800 187563799 187563798 187563797 187563796 187563795 187563794 187563793 187563792 187563791 187563790 187563789 187563788 187563787 187563786 187563785 187563784 187563783 187563782 187563781 187563780 187563779 187563778 187563777 187563776 187563775 187563774 187563773 187563772 187563771 187563770 187563769 187563768 187563767 187563766 187563765 187563764 187563763 187563762 187563761 187563760 187563759 187563758 187563757 187563756 187563755 187563754 187563753 187563752 187563751 187563750 187563749 187563748 187563747 187563746 187563745 187563744 187563743 187563742 187563741 187563740 187563739 187563738 187563737 187563736 187563735 187563734 187563733 187563732 187563731 187563730 187563729 187563728 187563727 187563726 187563725 187563724 187563723 187563722 187563721 187563720 187563719 187563718 187563717 187563716 187563715 187563714 187563713 187563712 187563711 187563710 187563709 187563708 187563707 187563706 187563705 187563704 187563703 187563702 187563701 187563700 187563699 187563698 187563697 187563696 187563695 187563694 187563693 187563692 187563691 187563690 187563689 187563688 187563687 187563686 187563685 187563684 187563683 187563682 187563681 187563680 187563679 187563678 187563677 187563676 187563675 187563674 187563673 187563672 187563671 187563670 187563669 187563668 187563667 187563666 187563665 187563664 187563663 187563662 187563661 187563660 187563659 187563658 187563657 187563656 187563655 187563654 187563653 187563652 187563651 187563650 187563649 187563648 187563647 187563646 187563645 187563644 187563643 187563642 187563641 187563640 187563639 187563638 187563637 187563636 187563635 187563634 187563633 187563632 187563631 187563630 187563629 187563628 187563627 187563626 187563625 187563624 187563623 187563622 187563621 187563620 187563619 187563618 187563617 187563616 187563615 187563614 187563613 187563612 187563611 187563610 187563609 187563608 187563607 187563606 187563605 187563604 187563603 187563602 187563601 187563600 187563599 187563598 187563597 187563596 187563595 187563594 187563593 187563592 187563591 187563590 187563589 187563588 187563587 187563586 187563585 187563584 187563583 187563582 187563581 187563580 187563579 187563578 187563577 187563576 187563575 187563574 187563573 187563572 187563571 187563570 187563569 187563568 187563567 187563566 187563565 187563564 187563563 187563562 187563561 187563560 187563559 187563558 187563557 187563556 187563555 187563554 187563553 187563552 187563551 187563550 187563549 187563548 187563547 187563546 187563545 187563544 187563543 187563542 187563541 187563540 187563539 187563538 187563537 187563536 187563535 187563534 187563533 187563532 187563531 187563530 187563529 187563528 187563527 187563526 187563525 187563524 187563523 187563522 187563521 187563520 187563519 187563518 187563517 187563516 187563515 187563514 187563513 187563512 187563511 187563510 187563509 187563508 187563507 187563506 187563505 187563504 187563503 187563502 187563501 187563500 187563499 187563498 187563497 187563496 187563495 187563494 187563493 187563492 187563491 187563490 187563489 187563488 187563487 187563486 187563485 187563484 187563483 187563482 187563481 187563480 187563479 187563478 187563477 187563476 187563475 187563474 187563473 187563472 187563471 187563470 187563469 187563468 187563467 187563466 187563465 187563464 187563463 187563462 187563461 187563460 187563459 187563458 187563457 187563456 187563455 187563454 187563453 187563452 187563451 187563450 187563449 187563448 187563447 187563446 187563445 187563444 187563443 187563442 187563441 187563440 187563439 187563438 187563437 187563436 187563435 187563434 187563433 187563432 187563431 187563430 187563429 187563428 187563427 187563426 187563425 187563424 187563423 187563422 187563421 187563420 187563419 187563418 187563417 187563416 187563415 187563414 187563413 187563412 187563411 187563410 187563409 187563408 187563407 187563406 187563405 187563404 187563403 187563402 187563401 187563400 187563399 187563398 187563397 187563396 187563395 187563394 187563393 187563392 187563391 187563390 187563389 187563388 187563387 187563386 187563385 187563384 187563383 187563382 187563381 187563380 187563379 187563378 187563377 187563376 187563375 187563374 187563373 187563372 187563371 187563370 187563369 187563368 187563367 187563366 187563365 187563364 187563363 187563362 187563361 187563360 187563359 187563358 187563357 187563356 187563355 187563354 187563353 187563352 187563351 187563350 187563349 187563348 187563347 187563346 187563345 187563344 187563343 187563342 187563341 187563340 187563339 187563338 187563337 187563336 187563335 187563334 187563333 187563332 187563331 187563330 187563329 187563328 187563327 187563326 187563325 187563324 187563323 187563322 187563321 187563320 187563319 187563318 187563317 187563316 187563315 187563314 187563313 187563312 187563311 187563310 187563309 187563308 187563307 187563306 187563305 187563304 187563303 187563302 187563301 187563300 187563299 187563298 187563297 187563296 187563295 187563294 187563293 187563292 187563291 187563290 187563289 187563288 187563287 187563286 187563285 187563284 187563283 187563282 187563281 187563280 187563279 187563278 187563277 187563276 187563275 187563274 187563273 187563272 187563271 187563270 187563269 187563268 187563267 187563266 187563265 187563264 187563263 187563262 187563261 187563260 187563259 187563258 187563257 187563256 187563255 187563254 187563253 187563252 187563251 187563250 187563249 187563248 187563247 187563246 187563245 187563244 187563243 187563242 187563241 187563240 187563239 187563238 187563237 187563236 187563235 187563234 187563233 187563232 187563231 187563230 187563229 187563228 187563227 187563226 187563225 187563224 187563223 187563222 187563221 187563220 187563219 187563218 187563217 187563216 187563215 187563214 187563213 187563212 187563211 187563210 187563209 187563208 187563207 187563206 187563205 187563204 187563203 187563202 187563201 187563200 187563199 187563198 187563197 187563196 187563195 187563194 187563193 187563192 187563191 187563190 187563189 187563188 187563187 187563186 187563185 187563184 187563183 187563182 187563181 187563180 187563179 187563178 187563177 187563176 187563175 187563174 187563173 187563172 187563171 187563170 187563169 187563168 187563167 187563166 187563165 187563164 187563163 187563162 187563161 187563160 187563159 187563158 187563157 187563156 187563155 187563154 187563153 187563152 187563151 187563150 187563149 187563148 187563147 187563146 187563145 187563144 187563143 187563142 187563141 187563140 187563139 187563138 187563137 187563136 187563135 187562134 187562133 187562132 187562131 187562130 187562129 187562128 187562127 187562126 187562125 187562124 187561123 187561122 187561121 187561120 187561119 187561118 187561117 187561116 187561115 187561114 187561113 187561112 187561111 187561110 187561109 187561108 187561107 187561106 187561105 187561104 187561103 187561102 187561101 186167268
->
Ordered series of contigs with or without gaps.
(Total: 3208)
Alignments to Genome
CpGDB displays high quality spliced alignments for EST , cDNA , PUT , Os-PEP , Probe ;
DNA alignments include [none ].
Search / Download
You can search or download any splice-aligned sequences, gene models, or genomic sequence from CpGDB. The entire CpGDB dataset can also be downloaded.
More about search / download...
Search / Download - Description
Resource
Description
Search by ID / Keyword
Search for any CpGDBgene or aligned sequence by ID or keyword , and download complete sequence or flanking 5' or 3' regions, exons, or introns (FASTA format).
Download Region Data
For any specified genomic region , download genomic DNA (FASTA format), all aligned/computed transcripts or proteins (FASTA format), or all genome annotations (GenBank, GFF3 or EMBL format).
Download All
Download bzip2 files and MySQL tables representing complete CpGDB dataset
View the latest Carica papaya sequence count at PlantGDB .
Tools
Sequence analysis tools accessed from the
Genome Context View menu use the current genomic region as input. Or, to access the same tools without a genomic context, use CpGDB left menubar Tools links.
More about tools...
Online Analytical Tools - Description
Name
Description
Source/Version
BLAST
Use BLASTn, BLASTp, tBLASTn and tBLASTx to match a query sequence to CpGDB sequences.
BLAST-able datasets include Carica papaya genomic DNA, splice-aligned transcripts and proteins, gene models, and other aligned sequences.
NCBI Blastall 2.2.18
GeneSeqer
Spliced alignment of user-specified transcript datasets to genomic DNA from any region in CpGDB. User can specify splice site model and stringency level.
Brendel Group (Oct 2008)
GenomeThreader
Spliced alignment of user-specified protein datasets to genomic DNA from any region in CpGDB. User can specify splice site model and stringency level.
GenomeThreader Home Page
Community Annotation
Help annotate the
Carica papaya genome using our yrGATE gene structure annotation tool (
see Overview ), aided by
GAEVAL tables that flag problematic gene models.
Video demo: QuickTime
Flash
This video is loading or may be currently unavailable!
Custom Track Display
Distributed Annotation Service (DAS) (
see Overview ) is available for displaying remotely served genome alignments at CpGDB, as well as for displaying selected CpGDB tracks on a different genome browser (e.g. Ensembl, GBrowse).
How to use DAS...
To add a DAS track to CpGDB using our DAS client, first select desired genome coordinates above and click "Go", then select menu item "Configure -> Add Track" and paste in the appropriate DAS URL.
To view CpGDB tracks in another genome browser (e.g. Ensembl, Gbrowse) using our DAS server, first find the appropriate xDAS Server URL on our DAS overview page, then follow instructions on the remote browser website for adding the remote track. NOTE: DAS service available for certain tracks only.
For more details, refer to DAS section in our Genome Browser help pages.
Additional custom track display features are under development.
Annotated Protein Alignments
Support
Genome browser video demo: QuickTime
Flash
For help pages and tutorials focusing on genome browser features and gene annotation, see side bar.